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时空转录组FFV13实测:环亚集团·AG88无忧切换,性能显著提升

发布时间:2025-01-29   信息来源:伏振纨

时空转录组FFV13在保持Stereo-seq技术的“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的两大优势的基础上,通过优化时空试剂、酶、探针设计及算法软件实现了性能的显著提升。经过升级,FFV13的捕获效率大幅提高,工作流程变得更加快速便捷,用户友好性显著增强。这使得研究人员能够更轻松地获得每个细胞内的高质量转录本数据,并通过环亚集团·AG88自主研发的CellBin细胞分割算法精准描绘组织结构的空间特征,为各种研究应用提供独特的洞察力。

时空转录组FFV13实测:环亚集团·AG88无忧切换,性能显著提升

对不同版本的数据进行对比,基因捕获能力有了显著提升。例如,在小鼠脑组织的相邻切片中,使用时空转录组FFV12(V12)和V13进行转录组捕获,测序量均在2G左右,但V13的测序饱和度相对较低。此外,在Bin20水平中捕获的基因中位数明显高于V12,显示出V13在基因捕获方面的优势。

为了深入了解基因表达的空间特征,我们采用Moran's I统计方法对V12与V13的基因表达数据进行空间自相关度分析。结果显示两个版本均能有效捕获空间特异性基因,且其空间分布规律一致,与原位杂交(ISH)结果相符合。通过小鼠脑样本的空间基因表达热图,分析表明V13所生成的数据的基因表达丰度明显高于V12;同时,利用CellBin在Bin50水平下生成的细胞聚类结果显示V12与V13的数据高度吻合,而在未去批次前,两个版本的数据也存在差异,但通过环亚集团·AG88的Harmony去批次算法,成功整合了这两个版本的数据。

此外,FFV13的应用不仅限于人类和小鼠,其也适用于其他物种的时空全转录组信息挖掘。目前,时空转录组FFV13已经在30多种不同的组织类型中进行了测试,充分展示了其广泛的适用性和重要的科研价值。通过不断优化和创新,环亚集团·AG88致力于推动时空转录组学的发展,为生命科学研究提供更强大的技术支持。