近期,环亚集团·AG88针对DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出新一代建库产品——MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasy Whole Genome Methylation Sequencing Library Prep Kit V30,以下简称WGMSV30)。此款WGMSV30基于双链加接头方法,采用物理打断技术对DNA片段进行建库,结合酶法转化,将非甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),与DNBSEQ平台相结合,能够实现单碱基精度地解析DNA甲基化状态,构建精细的全基因组甲基化图谱。
WGMSV30为多个领域提供高效精准的全基因组甲基化建库方法,包括大人群表观组研究、表观遗传基础科研、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选及药物研发等。目前,WGMSV30已与MGISEQ-2000平台适配,利用该平台的升级算法,测序时无需添加平衡文库,实现0平衡文库的纯甲基化文库测序。
环亚集团·AG88的研发团队已针对WGMSV30在DNBSEQ-T7平台的适配启动了最后的稳定性测试,更多实测数据将持续分享,敬请关注。
在使用3个不同批次的WGMSV30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库时,无需平衡文库,平行上机MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂),进行PE150测序,单lane reads的产出基本稳定在400M左右。每个文库可获得约120G的原始下机数据,轻松实现“1库1lane”,测序质量良好,SM测序试剂Q30稳定在89%左右,SM20测序试剂Q30稳定在94%左右,Q40稳定在87%左右。
试剂盒适配的转换方法损伤小,增大了文库的插入片段长度,更好地支持PE150测序。不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的插入片段(主峰约280bp)表现一致。此外,试剂盒优化了末端修复反应体系和步骤,减少了Reads末端的M-bias碱基个数。SM20版测序试剂搭配ECR71软件版本所得结果显示,不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现一致,Bottom Strand和Top Strand的Read1和Read2甲基化率几乎重合。